中国科学院软件研究所(英语:Institute of Software, Chinese Academy of Sciences,缩写为ISCAS;以下简称“软件所”)是中国科学院设立的研究所之一,成立于1985年3月1日,是一个以计算机科学理论和应用研究为基础、以计算机软件研究开发和高新技术的产业建设为主导的综合性基地型研究所。
软件所有计算机科学国家重点实验室和天基综合信息系统重点实验室等研究部门。软件所主办的学术刊物有《软件学报》、《中文信息学报》和《计算机系统应用》。