乌干达总统是乌干达的国家元首。这个职位设立初期,实权仍在总理手上。受到君主主义政党卡巴卡耶卡党的影响,布干达国王穆特萨二世成为了乌干达第一任总统。1966年,米尔顿·奥博特废止宪法,成为乌干达总理兼总统。从此以后,乌干达总统正式掌握实权。